Биоинформатик (анализ данных в сельском хозяйстве / Animal Science)

Обязанности:

• Анализ данных секвенирования (WGS на разных платформах и разными методам: чипы, low-pass, low-pass c обогащением). Понимать их суть и разницу, уметь анализировать данных полученные разными методами.
• Поиск генетических вариантов (SNP, CNV, Indels).
• Проведение полногеномного поиска ассоциаций (GWAS).
• Оценка племенной ценности животных (Genomic Selection).
• Ведение базы данных генотипов и фенотипов. Участвовать в создании аналитических отчетов по результатам деятельности, подготовка сопроводительной документации.

Требования:

• образование высшее,по специальности биоинформатика, генетика, биология

• Необходимые навыки:

• Опыт работы с геномными данными животных или растений.
• Владение языками Python или R для анализа данных.
• Опыт работы в консоли Linux (Bash) и с системами контроля версий (Git).
• Знание профильного софта (PLINK, BWA, GATK, SAMtools, BLUPf90).
• Понимание базовых принципов генетики количественных признаков.

Желательные навыки:

• Опыт анализа длинных чтений (Oxford Nanopore);
• Опыт работы с распространенными инструментами обработки NGS-данных (samtools, bedtools, bcftools etc, DeepVariant, GATK, IGV геномный браузер);
• Опыт разработки пайплайнов;
• Опыт работы с NGS-данными в генетике

Условия:

• Конкурентная з/п определяется по результатам собеседования
• ДМС
• Офисы на Шаболовской и Беляево
• Возможен гибридный график работы – несколько дней в офисе/несколько дней удаленная работа